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系统生物学实验

30学时 1学分 春季学期(3月-6月)
主讲教师: 洪炯、梁治
上课地点: 生物楼363室
 

实验内容
以微生物的基因调控网络为实验对象,训练学生对生物网络进行数学建模和计算机仿真的基本技能;通过实验课程学习基因调控网络的构建并结合数学模型进行定量分析;尝试设计基于数学模型的特定动力学特性或编程能力的基因表达网络并通过实验进行验证,使学生掌握对生物系统进行计算研究的一般方法。
1、基因调控网络动力学的理论建模与仿真(使用MATLAB对简单的生物系统进行建模、模拟和分析)
(1)、MATLAB入门
(2)、Michaelis-Menten动力学与Hill方程
(3)、噬菌体开关
2、基因表达控制系统的人工重构与定量分析
3、基于数学模型的基因表达控制系统的设计和实验验证“不同启动子调控基因表达的系统生物学观测”:构建不同强度的启动子,检测他们对基因进行表达的能力以及诱导物对表达强度的影响,使学生了解,在生物的复杂系统中,基因的表达可以通过启动子和诱导条件来调控。
 

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